Universidad de Chile, pese a las bajas del «Matador» Salas y de Luis Pedro Figueroa, incorporó a nuevos refuerzos como Jorge Acuña, Francisco Arrué, Patricio Galaz, Marco Estrada, Joel Soto y Mauricio Pinilla, camiseta borussia dortmund delantero formado en el club y cedido por seis meses por el Hearts de Escocia. En tanto, en el Torneo de Clausura 2006, luego de una mala campaña, nueva camiseta del barcelona Universidad de Chile fue eliminada en cuartos de final por Cobreloa.